Skip to content
Menu
CDhistory
CDhistory

Acidovorax kalamii sp. nov., isolated from a water sample of the river Ganges

Posted on 25 listopada, 2021 by admin

Gram-ujemny, prętokształtny, tlenowy, słomkowożółty, ruchliwy szczep, oznaczony KNDSW-TSA6T, należący do rodzaju Acidovorax, został wyizolowany z próbki wody z rzeki Ganges, poniżej miasta Kanpur, Uttar Pradesh, Indie. Komórki były tlenowe, nie tworzyły endospor i były ruchliwe z pojedynczą polarną flagą. Różnił się on od swoich filogenetycznie spokrewnionych szczepów cechami fenotypowymi, takimi jak hydroliza mocznika, żelatyny, kazeiny i DNA oraz reakcja katalazy. Głównymi kwasami tłuszczowymi były C16 : 1ω7c/C16 : 1ω6c, C16 : 0 i C18 : 1ω7c/C18 : 1ω6c. Analiza filogenetyczna oparta na sekwencjach genów 16S rRNA i housekeeping genes (gyrb, recA i rpoB) potwierdziła umieszczenie tego szczepu w obrębie rodzaju Acidovorax jako nowego gatunku. Szczep KNDSW-TSA6T wykazywał najwyższe podobieństwo sekwencji 16S rRNA do Acidovorax soli BL21T (98,9%), Acidovorax delafieldii ATCC 17505T (98,8%), Acidovorax temperans CCUG 11779T (98,2%), Acidovorax caeni R-24608T (97,9%) i Acidovorax radicis N35T (97,6%). Wartości cyfrowej hybrydyzacji DNA-DNA oraz średnie wartości identyczności nukleotydów obliczone na podstawie sekwencji całego genomu pomiędzy szczepem KNDSW-TSA6T a dwoma najbardziej spokrewnionymi szczepami A. soli BL21T i A. delafieldii ATCC 17505T były poniżej wartości progowych odpowiednio 70 i 95 %. Tak więc dane z polifazowej analizy taksonomicznej jednoznacznie wskazują, że szczep KNDSW-TSA6T reprezentuje nowy gatunek, dla którego zaproponowano nazwę Acidovorax kalamii sp. nov. Typem szczepu jest Acidovorax kalamii (=MTCC 12652T=KCTC 52819T=VTCC-B-910010T).

Dodaj komentarz Anuluj pisanie odpowiedzi

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany. Wymagane pola są oznaczone *

Ostatnie wpisy

  • Acela powraca: NYC lub Boston za 99 dolarów
  • OMIM Entry – # 608363 – CHROMOSOME 22q11.2 DUPLICATION SYNDROME
  • Rodzice Kate Albrecht – Dowiedz się więcej o jej ojcu Chrisie Albrechcie i matce Annie Albrecht
  • Temple Fork Outfitters
  • Burr (powieść)

Archiwa

  • luty 2022
  • styczeń 2022
  • grudzień 2021
  • listopad 2021
  • październik 2021
  • wrzesień 2021
  • sierpień 2021
  • lipiec 2021
  • czerwiec 2021
  • maj 2021
  • kwiecień 2021
  • DeutschDeutsch
  • NederlandsNederlands
  • SvenskaSvenska
  • DanskDansk
  • EspañolEspañol
  • FrançaisFrançais
  • PortuguêsPortuguês
  • ItalianoItaliano
  • RomânăRomână
  • PolskiPolski
  • ČeštinaČeština
  • MagyarMagyar
  • SuomiSuomi
  • 日本語日本語
©2022 CDhistory | Powered by WordPress & Superb Themes