W biologii molekularnej, białko wiążące acylo-CoA (ACBP) jest małym (10 Kd) białkiem, które wiąże średnio- i długołańcuchowe estry acylo-CoA z bardzo wysokim powinowactwem i może funkcjonować jako wewnątrzkomórkowy nośnik estrów acylo-CoA. ACBP jest również znane jako inhibitor wi±zania diazepamu (DBI) lub endozepiny (EP) z powodu zdolno¶ci do wypierania diazepamu z miejsca rozpoznawania benzodiazepin (BZD) znajduj±cego się na receptorze GABA typu A. Jest zatem możliwe, że białko to działa również jako neuropeptyd modulujący działanie receptora GABA.
| ACBP | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
Monomer białka wiążącego acylo-CoA, Human
|
||||||
| Identyfikatory | ||||||
| Symbol | ACBP | |||||
| Pfam | PF00887 | |||||
| InterPro | IPR000582 | |||||
| PROSITE | PDOC00686 | |||||
| SCOP2 | . 1aca / SCOPe / SUPFAM | |||||
| nadrodzina OPM | 295 | |||||
| białko OPM | 2wh5 | |||||
| CDD | cd00435 | |||||
| Membranome | 497 | |||||
| Dostępne struktury białek: | struktury Pfam | PDB | PDBsum | |||
ACBP jest wysoce konserwowanym białkiem o długości około 90 aminokwasów, które występuje we wszystkich czterech królestwach eukariotycznych, Animalia, Plantae, Fungi i Protista, oraz w niektórych gatunkach eubakterii.
Ale ACBP występuje jako całkowicie niezależne białko, nienaruszone domeny ACB zostały zidentyfikowane w wielu dużych, wielofunkcyjnych białkach u różnych gatunków eukariotycznych. Należą do nich duże białka związane z błonami z N-końcowymi domenami ACB, wielofunkcyjne enzymy z domenami ACB i peroksysomalnej izomerazy enoilo-CoA Delta(3), Delta(2)-enoilo-CoA oraz białka z domeną ACB i powtórzeniami ankirynowymi.
Domena ACB składa się z czterech alfa-helikali ułożonych w kształt miseczki z silnie wyeksponowanym miejscem wiązania acylo-CoA. Ligand jest wiązany poprzez specyficzne interakcje z resztami na białku, w szczególności z kilkoma konserwowanymi ładunkami dodatnimi, które oddziałują z grupą fosforanową na cząsteczce adenozyno-3’fosforanowej, a łańcuch acylowy jest umieszczony pomiędzy hydrofobowymi powierzchniami CoA i białka.
Inne białka zawierające domenę ACB obejmują:
- Endozepinopodobny peptyd (ELP) (gen DBIL5) z myszy. ELP jest specyficznym dla jądra homologiem ACBP, który może być zaangażowany w metabolizm energetyczny dojrzałego plemnika.
- MA-DBI, transmembranowe białko o nieznanej funkcji, które zostało znalezione u ssaków. MA-DBI zawiera N-końcową domenę ACB.
- DRS-1, ludzkie białko o nieznanej funkcji, które zawiera N-końcową domenę ACB i C-końcową domenę izomerazy/hydratyzy enoilo-CoA.
.