FlyBase
Informacje genetyczne, genomowe i molekularne odnoszące się do organizmu modelowego Drosophila melanogaster i związanych z nim sekwencji. Ta baza danych zawiera również informacje odnoszące się do modeli ludzkich chorób w Drosophila, wykorzystania konstrukcji transgenicznych zawierających sekwencje z innych organizmów w Drosophila, oraz informacje gdzie można kupić szczepy i konstrukty Drosophila. Comparative Toxicogenomics Database
Baza danych Comparative Toxicogenomics Database (CTD) przyczynia się do zrozumienia wpływu chemikaliów środowiskowych na zdrowie człowieka. Biokuratorzy ręcznie gromadzą związki chemia-geny, chemia-choroba i gen-choroba z literatury naukowej. Te podstawowe dane są następnie wewnętrznie integrowane w celu wygenerowania sieci powiązań chemia-geny-choroby. Dodatkowo, dane podstawowe są integrowane z zewnętrznymi zestawami danych (takimi jak Gene Ontology i anotacje ścieżek) w celu przewidywania wielu nowych powiązań pomiędzy różnymi typami danych. Unikalną i potężną cechą CTD jest wnioskowanie o związkach wygenerowanych przez integrację danych, która pomaga przekształcić wiedzę w odkrycia, identyfikując nowe powiązania między chemikaliami, genami, chorobami, ścieżkami i adnotacjami GO, które mogłyby nie być widoczne przy użyciu innych zasobów biologicznych. Orphanet
Orphanet jest źródłem informacji o rzadkich chorobach i lekach sierocych dla wszystkich odbiorców. Jego celem jest przyczynienie się do poprawy diagnostyki, opieki i leczenia pacjentów z rzadkimi chorobami. Orphanet utrzymuje nomenklaturę Orphanet, niezbędną dla interoperacyjności, oraz ontologię rzadkich chorób Orphanet (ORDO). Moroccan Genetic Disease Database
The Moroccan Genetic Disease Database (MGDD) gromadzi i dokumentuje mutacje i częstotliwości polimorfizmów zgłoszonych w populacji marokańskiej. Informacje zawarte w MGDD pozwalają naukowcom i klinicystom na znalezienie mutacji związanych z daną chorobą lub interesującym ich genem, a także na znalezienie polimorfizmów związanych z podatnością na choroby genetyczne lub indywidualną odpowiedzią na leki farmaceutyczne lub czynniki środowiskowe. MouseMine @ MGI
Baza danych zintegrowanych danych o myszach z MGI, zasilana przez InterMine. MouseMine jest członkiem InterMOD, konsorcjum baz danych organizmów modelowych, którego celem jest ułatwienie analizy danych międzygatunkowych poprzez ciągłą koordynację i wspólny rozwój systemu. Online Mendelian Inheritance in Man
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) jest wszechstronnym, autorytatywnym kompendium ludzkich genów i fenotypów genetycznych, które jest swobodnie dostępne i codziennie aktualizowane. Pełnotekstowe, referencyjne przeglądy w OMIM zawierają informacje na temat wszystkich znanych zaburzeń mendlowskich i ponad 15 000 genów. OMIM koncentruje się na relacji między fenotypem a genotypem. Target Central Resource Database
TCRD jest centralnym zasobem w Illuminating the Druggable Genome Knowledge Management Center (IDG-KMC). TCRD zawiera informacje na temat ludzkich celów, ze szczególnym naciskiem na cztery rodziny celów, które są kluczowe dla inicjatywy NIH IDG: GPCRs, kinaz, kanałów jonowych i receptorów jądrowych. Węchowe GPCRs (oGPCRs) są traktowane jako oddzielna rodzina. Kluczowym celem KMC jest sklasyfikowanie poziomu rozwoju/zdolności do leczenia poszczególnych celów. Oficjalnym portalem publicznym dla TCRD jest Pharos (pharos.nih.gov). Interfejs Pharos, oparty na nowoczesnych zasadach projektowania stron internetowych, zapewnia łatwy dostęp do wszystkich rodzajów danych gromadzonych przez KMC. Biorąc pod uwagę złożoność danych dotyczących dowolnego celu, wydajna i intuicyjna wizualizacja ma wysoki priorytet, aby umożliwić użytkownikom szybkie poruszanie się po & podsumowaniu wyników wyszukiwania i szybką identyfikację wzorców. Krytyczną cechą interfejsu jest możliwość elastycznego wyszukiwania i późniejszego drążenia wyników wyszukiwania. Podstawą interfejsu jest RESTful API, który zapewnia programowy dostęp do wszystkich danych KMC, pozwalając na ich łatwe wykorzystanie w aplikacjach użytkownika. Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues 2.0
GIANT2 (Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues) jest interaktywnym serwerem internetowym, który umożliwia badaczom biomedycznym analizowanie ich białek i ścieżek zainteresowania oraz generowanie hipotez w kontekście genomowych map funkcjonalnych ludzkich tkanek. Dzięki GIANT2 naukowcy mogą badać przewidywane, specyficzne dla tkanek role funkcjonalne genów i odkrywać zmiany w tych rolach w różnych tkankach, a wszystko to poprzez interaktywne wizualizacje i analizy wielu sieci. Mitochondrial Disease Sequence Data Resource
Mitochondrial Disease Sequence Data Resource (MSeqDR) jest scentralizowanym zasobem bioinformatycznym genomu i fenomu zbudowanym przez społeczność zajmującą się chorobami mitochondrialnymi w celu ułatwienia diagnostyki klinicznej i badań nad fenotypami, genomami, genami i wariantami poszczególnych pacjentów. Integruje on wiedzę społeczności z baz danych prowadzonych przez ekspertów z danymi genomowymi i fenotypowymi udostępnianymi przez klinicystów i badaczy. Editome Disease Knowledgebase
The Editome Disease Knowledgebase (EDK) jest zintegrowaną bazą wiedzy na temat powiązań pomiędzy edycją RNA a chorobami, ręcznie opracowaną na podstawie opublikowanej literatury. Przechowuje ona informacje na temat zdarzeń związanych z edycją RNA w mRNA, miRNA, lncRNA, wirusach i enzymach związanych z różnymi chorobami człowieka.
.