Zestaw „segmentów ekspansji” każdego eukariotycznego genu 26S/28S rybosomalnego RNA (rRNA) jest odpowiedzialny za większość różnicy w długości między prokariotycznym genem 23S rRNA a eukariotycznym genem 26S/28S rRNA. Segmenty ekspansywne są również odpowiedzialne za międzygatunkowe fluktuacje długości w trakcie ewolucji eukariotycznej. Wykazuj± one konsekwentn± tendencyjno¶ć w składzie zasad u każdego gatunku; na przykład, s± bogate w AT u Drosophila melanogaster i bogate w GC u kręgowców. Porównania dot-matrix zestawów odcinków ekspansji ujawniają wysokie podobieństwo między członkami zestawu w obrębie dowolnego genu 28S rRNA danego gatunku, w przeciwieństwie do niewielkiego lub pozornego podobieństwa, które istnieje między zestawami odcinków ekspansji z odległych gatunków. Podobieństwa między członkami zestawu segmentów ekspansji w obrębie dowolnego genu 28S rRNA nie można wyjaśnić jedynie na podstawie ich stosunku bazowo-składnikowego. W przeciwieństwie do tego, nie ma znaczącego podobieństwa w obrębie zestawu segmentów „rdzeniowych” (regionów pomiędzy segmentami ekspansywnymi) dowolnego genu 28S rRNA, chociaż segmenty rdzeniowe są konserwowane pomiędzy gatunkami. Zestaw segmentów ekspansyjnych genu 26S/28S koewoluuje jako jednostka u każdego gatunku, w tym samym czasie, gdy rodzina genów 28S rRNA jako całość podlega ciągłej homogenizacji, co sprawia, że wszystkie zestawy segmentów ekspansyjnych ze wszystkich matryc rybosomalnego DNA (rDNA) u danego gatunku są podobne w sekwencji. Analiza prostoty DNA genów 26S/28S rRNA wykazuje bezpośrednią korelację pomiędzy istotnie wysokimi współczynnikami względnej prostoty (RSF) a podobieństwem sekwencji zestawu segmentów ekspansyjnych. Podobna korelacja istnieje między wartościami RSF, ogólnymi długościami rDNA i długościami poszczególnych segmentów ekspansywnych. Takie korelacje sugeruj±, że większo¶ć fluktuacji długo¶ci odzwierciedla zdobywanie i utratę prostych motywów sekwencyjnych przez mechanizmy podobne do po¶lizgu. Omawiamy molekularną koewolucję segmentów ekspansywnych, która odbywa się na tle mechanizmów rotacji typu slippage i nierównomiernego crossing-over, odpowiedzialnych za akumulację międzygatunkowych różnic w sekwencjach rDNA.