Sobre 3D-NuS
3D-NuS (3-Dimensional Nucleic Acid Structures) é um servidor web para modelagem e visualização de estruturas tridimensionais de dúplexos de DNA/RNA intra/intermoleculares com pares de bases não-canônicas juntamente com suas formas quiméricas & ii) dúplexos híbridos de RNA-DNA, iii) duplex Z-DNA/Z-RNA esquerda, iv) triplexes e vi) intra/intermolecular G-quadruplexes de forma automatizada. Também gera um conjunto de conformações correspondente à estrutura modelada.
3D-NuS constrói duplexes de DNA e RNA contendo todas as combinações possíveis de desajustes juntamente com pares de bases canônicas de forma automatizada. 3D-NuS dá a facilidade de construir várias formas de triplex e quadruplexos para diferentes tipos de combinações de fios de RNA/DNA juntamente com diferentes orientações de fios. Atualmente, o 3D-NuS pode gerar modelos minimizados de energia de 80 tipos diferentes de triplexes, 58 tipos de quadruplexes intra/intermoleculares, modelos de DNA/RNA e quimeras de DNA/RNA, juntamente com uma variedade de mismatch contendo duplex de DNA ou RNA e duplex híbrido de RNA-DNA para qualquer seqüência e comprimento definidos pelo usuário. Estes são mais detalhados na documentação e na página de modelagem molecular correspondente.
