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Proteína ligante de Acyl-CoA

Posted on Novembro 13, 2021 by admin

Na biologia molecular, a proteína ligante de Acyl-CoA (ACBP) é uma proteína pequena (10 Kd) que liga ésteres de acyl-CoA de cadeia média e longa com afinidade muito alta e pode funcionar como um portador intracelular de ésteres de acyl-CoA. O ACBP também é conhecido como inibidor de ligação do diazepam (DBI) ou endozepina (EP) devido à sua capacidade de deslocar o diazepam do local de reconhecimento da benzodiazepina (BZD) localizado no receptor GABA tipo A. É portanto possível que esta proteína também actue como neuropeptídeo para modular a acção do receptor GABA.

estruturas / ECOD

RCSB PDB; PDBe; PDBj

resumo da estrutura

ACBP
2cb8.jpg

Monómero proteico de ligação a Cila e CoA, Humanos
Identificadores
Símbolo ACBP
Pfam PF00887
InterPro IPR000582
PROSITE PDOC00686
SCOP2 1aca / SCOPe / SUPFAM
OPM superfamily 295
OPM protein 2wh5
CDD cd00435
Membranome 497
Estruturas proteicas disponíveis: Pfam PDB PDBsum

ACBP é uma proteína altamente conservada de cerca de 90 aminoácidos que é encontrada nos quatro reinos eucarióticos, Animalia, Plantae, Fungos e Protista, e em algumas espécies eubacterianas.

Embora a ACBP ocorra como uma proteína completamente independente, domínios ACB intactos foram identificados em uma série de proteínas grandes e multifuncionais em uma variedade de espécies eucarióticas. Estes incluem grandes proteínas associadas à membrana com domínios N-terminais ACB, enzimas multifuncionais com ACB e peroxisomal enoyl-CoA Delta(3), domínios Delta(2)-enoyl-CoA isomerase, e proteínas com domínio ACB e repetidas anquirinas.

O domínio ACB consiste em quatro alfahelices dispostos em forma de tigela com um local de ligação acilo-CoA altamente exposto. O ligante é ligado através de interações específicas com resíduos na proteína, mais notadamente várias cargas positivas conservadas que interagem com o grupo fosfato na meada adenosina-3’fosfato, e a cadeia de acilo é colada entre as superfícies hidrofóbicas de CoA e a proteína.

Outras proteínas contendo um domínio ACB incluem:

  • Peptídeo tipo endozepina (ELP) (gene DBIL5) do rato. A ELP é um homólogo ACBP específico do testículo que pode estar envolvido no metabolismo energético do esperma maduro.
  • MA-DBI, uma proteína transmembrana de função desconhecida que tem sido encontrada em mamíferos. MA-DBI contém um domínio N-terminal ACB.
  • DRS-1, uma proteína humana de função desconhecida que contém um domínio N-terminal ACB e um domínio C-terminal enoyl-CoA isomerase/hidratase.

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