Condițiile din închisoare erau îngrozitoare. Avea podeaua murdară, era plină de păduchi, întunecată, lugubră și mirosea a tutun și a bălegar. Era cald vara și frig iarna. Gratii de fier acopereau ferestrele. În încercarea de a împiedica spectrele acuzaților să zboare libere și să-i acosteze pe cei suferinzi, gardienii închisorii foloseau cătușe pentru a-i ține pe condamnați – inclusiv pe cei tineri, bătrâni și bolnavi. Cei întemnițați trebuiau să plătească pentru cazare și masă (aproximativ doi șilingi, șase pence pe săptămână), plus o taxă pentru lanțuri. Nu se știe sigur dacă existau celule subterane; „temniță” însemna probabil camera principală de la primul etaj.
A fost în închisoarea Salem unde Martha Corey a fost excomunicată înainte de a fi spânzurată la 22 septembrie. De aici, Giles Corey a fost dus pe un câmp deschis și strivit până la moarte, într-un efort de a-l forța să fie judecat. Nepoata de 17 ani a lui George Jacobs, care își implicase bunicul în vrăjitorie, a scris o scrisoare în care îi cerea iertare în timp ce își aștepta execuția în închisoarea din Salem. Margaret Jacobs fusese ea însăși acuzată și, de teamă, mărturisise vrăjitoria și acuzase mai multe persoane, inclusiv pe bunicul ei. Tot aici a fost și locul în care Mary Warren, servitoarea lui John și Elizabeth Proctor, a fost examinată de magistrați și de reverenzi. Warren susținuse că era bolnavă, acuzându-și angajatorii. Când a retractat, a fost și ea acuzată de vrăjitorie.
După ce o persoană era condamnată pentru vrăjitorie, era de obicei doar o chestiune de zile până când era executată. Înaltul șerif al comitatului Essex, George Corwin, îi lua pe condamnați de la închisoare, iar aceștia erau duși cu căruța, cu gărzile călare alături, la locul de execuție de la marginea orașului.
O nouă închisoare din Salem a fost construită în 1813, peste Prison Lane, unde aceasta se intersecta cu Bridge Street, mai aproape de North River. Bârnele vechii închisori au fost folosite pentru a construi o reședință pe vechiul amplasament în 1863 de către Abner Cheney Goodall. Familia Goodall, care încă mai deținea clădirea în anii 1930, a deschis prima atracție „Witch City” din Salem în acel deceniu. Aceștia au recreat o închisoare și au perceput o taxă de intrare pentru a vizita „Old Witch Jail and Dungeon.”
La mijlocul anilor 1950, New England Telephone Company a ras clădirea pentru a face loc noii lor clădiri de birouri, situată la 10 Federal Street. Nu au existat prea multe proteste cu privire la pierderea sitului istoric. Vechea atracție s-a mutat într-o clădire de pe Lynde Street, care fusese construită inițial ca o capelă pentru East Church și apoi a găzduit, din 1908 până în 1980, Biserica Științei Creștine din Salem. Deschisă în 1980, atracția funcționează și astăzi sub numele de Muzeul Witch Dungeon. În timpul săpăturilor pentru noua clădire de telefonie de pe Federal Street, au fost descoperite grinzi din vechea închisoare. Astăzi, una este expusă la Muzeul Vrăjitoarelor din Salem, una este expusă la Muzeul Temniței Vrăjitoarelor și una se află în colecția Muzeului Peabody Essex.