Despre 3D-NuS
3D-NuS (3-Dimensional Nucleic Acid Structures) este un server web pentru modelarea și vizualizarea structurilor tridimensionale ale structurilor de dreapta i) duplexuri intra/intermoleculare ADN/ARN cu perechi de baze necanonice împreună cu formele lor chimerice & ii) duplexuri hibride ARN-ADN, iii) duplexurile Z-ADN/Z-ARN cu mâna stângă, iv) triplexurile și vi) cvadruplexurile G intra/intermoleculare într-un mod automatizat. De asemenea, generează un ansamblu de conformații care corespund structurii modelate.
3D-NuS construiește duplexuri de ADN și ARN care conțin toate combinațiile posibile de nepotriviri împreună cu perechile de baze canonice într-un mod automatizat. 3D-NuS oferă facilitatea de a construi diverse forme de triplexe și cvadruplexe pentru diferite tipuri de combinații de șiruri de ARN/ADN împreună cu diferite orientări ale șirurilor. În prezent, 3D-NuS poate genera modele minimizate din punct de vedere energetic pentru 80 de tipuri diferite de triplexuri, 58 de tipuri de cvadruplexe intra/intermoleculare, modele Z ADN/ARN și modele de chimeră ADN/ARN, precum și o varietate de duplexuri ADN sau ARN care conțin dezacorduri și duplexuri hibride ARN-ADN pentru orice secvență și lungime definite de utilizator. Acestea sunt detaliate în continuare în documentație și în pagina de modelare moleculară corespunzătoare.
