abYsis este un sistem de cercetare a anticorpilor bazat pe web care include o bază de date integrată de date privind secvența și structura anticorpilor. Sistemul poate fi interogat în numeroase moduri – de la căutări simple de text și secvență până la interogări sofisticate care aplică constrângeri structurale 3D. Versiunea disponibilă publicului include date de secvență preanalizate de la European Molecular Biology Laboratory European Nucleotide Archive (EMBL-ENA) și Kabat, precum și date de structură de la Protein Data Bank. Secvențele proprii ale unui cercetător pot fi, de asemenea, analizate prin intermediul interfeței web. O caracteristică definitorie a abYsis este faptul că secvențele sunt numerotate automat cu o serie de scheme populare, cum ar fi Kabat și Chothia, și apoi adnotate cu informații cheie, cum ar fi regiunile care determină complementaritatea și potențialele modificări post-translaționale. Un aspect unic al abYsis este un set de tabele de frecvență a reziduurilor pentru fiecare poziție a unui anticorp, care permite evidențierea „reziduurilor neobișnuite” (cele rar întâlnite într-o anumită poziție) și luarea de decizii cu privire la mutațiile care pot fi acceptabile. Acest lucru este deosebit de util atunci când se compară anticorpi din specii diferite. abYsis este util pentru orice cercetător specializat în ingineria anticorpilor, în special pentru cei care dezvoltă anticorpi ca medicamente. abYsis este disponibil la www.abysis.org.