În biologia moleculară, proteina de legare a acilico-CoA (ACBP) este o proteină mică (10 Kd) care leagă esterii de acilico-CoA cu lanț mediu și lung cu o afinitate foarte mare și poate funcționa ca un transportor intracelular de esteri de acilico-CoA. ACBP este cunoscută și sub denumirea de inhibitor de legare a diazepamului (DBI) sau endozepină (EP), datorită capacității sale de a deplasa diazepamul de la locul de recunoaștere a benzodiazepinei (BZD) situat pe receptorul GABA de tip A. Prin urmare, este posibil ca această proteină să acționeze, de asemenea, ca o neuropeptidă pentru a modula acțiunea receptorului GABA.
| ACBP | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
Proteina de legare a acil-CoA monomer, umană
|
||||||
| Identificatori | ||||||
| Simbol | ACBP | |||||
| Pfam | PF00887 | |||||
| InterPro | IPR000582 | |||||
| PROSITE | PDOC00686 | |||||
| SCOP2 | . 1aca / SCOPe / SUPFAM | |||||
| Superfamilia OPM | 295 | |||||
| Proteina OPM | 2wh5 | |||||
| CDD | cd00435 | |||||
| Membranomul | 497 | |||||
| Structuri proteice disponibile: | structuri Pfam | PDB | PDBsum | |||
ACBP este o proteină foarte conservată de aproximativ 90 de aminoacizi care se găsește în toate cele patru regnuri eucariote, Animalia, Plantae, Fungi și Protista, precum și în unele specii eubacteriene.
Deși ACBP apare ca o proteină complet independentă, domeniile ACB intacte au fost identificate într-un număr de proteine mari, multifuncționale, într-o varietate de specii eucariote. Acestea includ proteine mari asociate membranei cu domenii ACB N-terminale, enzime multifuncționale atât cu domenii ACB, cât și cu domenii enoil-CoA Delta(3), Delta(2)-enoil-CoA izomerază peroxisomală și proteine care au atât un domeniu ACB, cât și repetări de anchirină.
Domeniul ACB constă din patru alfa-helice dispuse în formă de castron cu un situs de legare a acil-CoA foarte expus. Ligandul este legat prin interacțiuni specifice cu reziduuri de pe proteină, mai ales câteva sarcini pozitive conservate care interacționează cu grupul fosfat de pe fracțiunea adenozină-3’fosfat, iar lanțul acil este așezat între suprafețele hidrofobe ale CoA și proteinei.
Alte proteine care conțin un domeniu ACB includ:
- Endozepine-like peptide (ELP) (gena DBIL5) de la șoarece. ELP este un omolog ACBP specific testiculului care poate fi implicat în metabolismul energetic al spermatozoizilor maturi.
- MA-DBI, o proteină transmembranară cu funcție necunoscută care a fost găsită la mamifere. MA-DBI conține un domeniu ACB N-terminal.
- DRS-1, o proteină umană cu funcție necunoscută care conține un domeniu ACB N-terminal și un domeniu enoil-CoA izomerază/hidratază C-terminal.
.