Se prezintă o imagine generală a modificărilor expresiei genetice de-a lungul unei curbe de timp în primele 20 de minute după acidificarea la pH 4,5 a culturilor în creștere exponențială ale tulpinii Staphylococcus aureus 50583, patogenă pentru alimente. Pentru a detecta răspunsurile semnificative ale expresiei genice, a fost utilizată o metodă nou dezvoltată pentru testarea semnificației statistice. Majoritatea răspunsurilor au prezentat o creștere sau o scădere de la timpul zero până la 10 minute după acidificare și apoi, în general, o stabilizare a nivelului de expresie de la 10 la 20 de minute. Activitatea crescută a ureazei a părut a fi un factor important în apărarea împotriva acidității, alături de excreția de protoni de către NADH dehidrogenază și mecanismele de reparare a macromoleculelor. Au fost, de asemenea, induse răspunsuri la stresul oxidativ, cum ar fi creșterea expresiei genelor de tioredoxină și reglarea în sus a genelor căii pentozei fosfat pentru a genera mai multă putere de reducere. O reducere generală a expresiei genelor care codifică proteinele ribozomale și a genelor implicate în sinteza nucleotidelor, precum și în metabolismul acizilor grași și al lipoproteinelor, a reflectat reducerea ratei de creștere după acidificare. Șocul pH-ului nu pare să fi declanșat răspunsuri majore de virulență sau formarea de biofilme. Reglarea și transportul ionilor metalici au fost afectate de șocul acid, iar producția mai multor cofactori, cum ar fi molibdopterina, a crescut. Multe dintre observațiile prezentate au putut fi explicate, în timp ce unele reprezintă mecanisme încă necunoscute. Tiparele de reglare au fost confirmate prin PCR cantitativă cu transcriptază inversă (QRT-PCR). Împreună, aceste rezultate au arătat principalele răspunsuri ale S. aureus și vor fi un bun punct de plecare pentru viitoarele studii mai specifice și mai aprofundate ale răspunsurilor genetice specifice care apar în legătură cu apărarea împotriva stresului acid a S. aureus.