Cancerläkemedlen adriamycin och daunomycin har var och en kristalliserats med DNA-sekvensen d(CGATCG) och de tredimensionella strukturerna av komplexen har lösts med en upplösning på 1,7 respektive 1,5 A. Dessa antitumörläkemedel har avsevärt olika kliniska egenskaper, men de skiljer sig kemiskt endast genom den extra hydroxylgruppen vid C14 i adriamycin. I dessa komplex är kromoforen interkalerad vid CpG-stegen i båda ändarna av DNA-helixen med aminosockret utsträckt in i det lilla spåret. Lösningen av strukturen av daunomycin bundet till d(CGATCG) har gjort det möjligt att jämföra den med den tidigare rapporterade strukturen av daunomycin bundet till d(CGTACG). Även om de två daunomycinkomplexen är likartade finns det ett intressant sekvensberoende av aminosockrets bindning till A-T-basparet utanför interkalationsplatsen. Komplexet av daunomycin med d(CGATCG) har tätare bindning än komplexet med d(CGTACG), vilket får oss att dra slutsatsen att det finns en sekvenspreferens i bindningen av detta antracyklinläkemedel. Strukturerna av daunomycin och adriamycin med d(CGATCG) är mycket lika. Det finns dock ytterligare lösningsmedelsinteraktioner med adriamycin C14 hydroxyl som binder det till DNA. Överraskande nog finns det under inflytande av den förändrade solvationen en avsevärd skillnad i sperminekonformationen i dessa två komplex. De observerade förändringarna i de ternära komplexens övergripande strukturer förstärker de små kemiska skillnaderna mellan dessa två antibiotika och ger en möjlig förklaring till de avsevärt olika kliniska aktiviteterna hos dessa viktiga läkemedel.
Organisatorisk anknytning: 
Det biologiska institutet, Massachusetts Institute of Technology, Cambridge 02139.
Dölj hela sammanfattningen.