abYsis är ett webbaserat forskningssystem för antikroppar som innehåller en integrerad databas med sekvens- och strukturdata för antikroppar. Systemet kan användas på många olika sätt – från enkla text- och sekvenssökningar till sofistikerade förfrågningar som tillämpar 3D-strukturella begränsningar. Den allmänt tillgängliga versionen innehåller föranalyserade sekvensdata från European Molecular Biology Laboratory European Nucleotide Archive (EMBL-ENA) och Kabat samt strukturdata från Protein Data Bank. En forskares egna sekvenser kan också analyseras via webbgränssnittet. Ett utmärkande kännetecken för abYsis är att sekvenserna numreras automatiskt med en rad populära scheman, t.ex. Kabat och Chothia, och sedan kommenteras med nyckelinformation, t.ex. komplementaritetsbestämmande regioner och potentiella posttranslationella modifieringar. En unik aspekt av abYsis är en uppsättning tabeller över restfrekvenser för varje position i en antikropp, vilket gör det möjligt att lyfta fram ”ovanliga rester” (de som sällan förekommer i en viss position) och fatta beslut om vilka mutationer som kan vara acceptabla. Detta är särskilt användbart när man jämför antikroppar från olika arter. abYsis är användbart för alla forskare som specialiserar sig på antikroppsteknik, särskilt de som utvecklar antikroppar som läkemedel. abYsis finns på www.abysis.org.