Acidogenes är det andra steget i de fyra stegen av anaerob nedbrytning:
- Hydrolys: En kemisk reaktion där partiklar löses upp och stora polymerer omvandlas till enklare monomerer;
- Acidogenes: En biologisk reaktion där enkla monomerer omvandlas till flyktiga fettsyror;
- Acetogenes: En biologisk reaktion där flyktiga fettsyror omvandlas till ättiksyra, koldioxid och väte
- Metanogenes:
Anaerob nedbrytning är en komplex biokemisk process med biologiskt medierade reaktioner av ett konsortium av mikroorganismer för att omvandla organiska föreningar till metan och koldioxid. Det är en stabiliseringsprocess som minskar lukt, patogener och massreduktion.
Hydrolytiska bakterier bildar en mängd olika reducerade slutprodukter från jäsningen av ett visst substrat. En grundläggande fråga som uppstår gäller de metaboliska egenskaper som styr kol- och elektronflödet till en viss reducerad slutprodukt under renkultur och blandade metanogena kulturer av hydrolytiska bakterier. Thermoanaerobium brockii är en representativ termofil, hydrolytisk bakterie som fermenterar glukos via Embden-Meyerhof Parnas-vägen. T. brockii är en atypisk heteromjölksbakterie eftersom den bildar molekylärt väte (H2) utöver mjölksyra och etanol. De reducerade slutprodukterna från glukosjäsning bildas enzymatiskt från pyruvat via följande mekanismer: laktat genom ] allfosfat (F6P) aktiverat laktatdehydrogenas, H2 genom pyruvatferredoxinoxidoreduktas och hydrogenas, och etanol via NADH- och NADPH-länkat alkoholdehydrogenas.
Vid sin sida hittades den acidogena aktiviteten i början av 1900-talet, men det var inte förrän i mitten av 1960-talet som man antog tekniken för fasseparation för att förbättra stabiliteten och behandlingen av avfallsrötkamrar. I denna fas depolymeriseras komplexa molekyler (kolhydrater, lipider och proteiner) till lösliga föreningar av hydrolytiska enzymer (cellulaser, hemicellulaser, amylaser, lipaser och proteaser). De hydrolyserade föreningarna fermenteras till flyktiga fettsyror (acetat, propionat, butyrat och laktat), neutrala föreningar (etanol, metanol), ammoniak, väte och koldioxid.
Acetogenes är en av huvudreaktionerna i detta skede, i detta metaboliseras de producerade intermediära metaboliterna till acetat, väte och kolsyragas av de tre huvudgrupperna av bakterier:
- homoacetogener;
- syntrofer; och
- sulforeduktorer.
För ättiksyraproduktion anses tre typer av bakterier:
- Clostridium aceticum;
- Acetobacter woodii; och
- Clostridium termoautotrophicum.
Winter y Wolfe visade 1979 att A. wodii i syntrofisk association med Methanosarcina producerar metan och koldioxid från fruktos, istället för tre molekyler acetat. Moorella thermoacetica och Clostridium formiaceticum kan reducera kolgasen till acetat, men de har inga hydrogenaser som inhabiliterar vätgasanvändningen, så de kan producera tre molekyler acetat från fruktos. Ättiksyra är också en sammetabolit från fermentering av organiska substrat (socker, glycerol, mjölksyra osv.) av olika grupper av mikroorganismer som producerar olika syror: *propioniska bakterier (propionat + acetat),
- Clostridium (butyrat + acetat),
- Enterobacteria (acetat + laktat), och
- Heterofermentativa bakterier (acetat, propionat, butyrat, valerat etc.).