Molekylbiologiskt är Acyl-CoA-bindande protein (ACBP) ett litet (10 Kd) protein som binder medel- och långkedjiga acyl-CoA-estrar med mycket hög affinitet och kan fungera som en intracellulär transportör av acyl-CoA-estrar. ACBP är också känt som diazepambindningshämmare (DBI) eller endozepin (EP) på grund av sin förmåga att tränga undan diazepam från bensodiazepinets (BZD) igenkänningsställe som är beläget på GABA-receptorn av typ A. Det är därför möjligt att detta protein också fungerar som en neuropeptid för att modulera GABA-receptorns verkan.
| ACBP | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
Acyl-CoA-bindande proteinmonomer, Human
|
||||||
| Identifiers | ||||||
| Symbol | ACBP | |||||
| Pfam | PF00887 | |||||
| InterPro | IPR000582 | |||||
| PROSITE | PDOC00686 | |||||
| SCOP2 | 1aca / SCOPe / SUPFAM | |||||
| OPM superfamily | 295 | |||||
| OPM protein | 2wh5 | |||||
| CDD | cd00435 | |||||
| Membranom | 497 | |||||
| Föreligger proteinstrukturer: | Pfam | PDB | PDBsum | |||
ACBP är ett mycket bevarat protein med cirka 90 aminosyror som finns i alla fyra eukaryotiska riken, Animalia, Plantae, Fungi och Protista, samt i vissa eubakteriella arter.
Och även om ACBP förekommer som ett helt självständigt protein har intakta ACB-domäner identifierats i ett antal stora, multifunktionella proteiner i en rad olika eukaryota arter. Dessa inkluderar stora membranassocierade proteiner med N-terminala ACB-domäner, multifunktionella enzymer med både ACB- och peroxisomala enoyl-CoA Delta(3)-, Delta(2)-enoyl-CoA isomeras-domäner och proteiner med både en ACB-domän och ankyrinrepeats.
AcB-domänen består av fyra alfa-helixer som är arrangerade i en skålform med en högt exponerad acyl-CoA-bindningsplats. Liganden binds genom specifika interaktioner med rester på proteinet, framför allt flera konserverade positiva laddningar som interagerar med fosfatgruppen på adenosin-3′-fosfatdelen, och acylkedjan är inlagd mellan de hydrofoba ytorna hos CoA och proteinet.
Andra proteiner som innehåller en ACB-domän är bland annat:
- Endozepinliknande peptid (ELP) (gen DBIL5) från mus. ELP är en testikelspecifik ACBP-homolog som kan vara involverad i energimetabolismen hos mogna spermier.
- MA-DBI, ett transmembranprotein med okänd funktion som har hittats hos däggdjur. MA-DBI innehåller en N-terminal ACB-domän.
- DRS-1, ett humant protein med okänd funktion som innehåller en N-terminal ACB-domän och en C-terminal enoyl-CoA isomeras/hydratas-domän.