FlyBase
Genetisk, genomisk och molekylär information om modellorganismen Drosophila melanogaster och relaterade sekvenser. Denna databas innehåller också information om mänskliga sjukdomsmodeller i Drosophila, användning av transgena konstruktioner som innehåller sekvenser från andra organismer i Drosophila och information om var man kan köpa Drosophila stammar och konstruktioner. Comparative Toxicogenomics Database
Databasen Comparative Toxicogenomics Database (CTD) främjar förståelsen av miljökemikaliers effekter på människors hälsa. Biokuratorer kurerar manuellt relationer mellan kemikalier och gener, kemikalier och sjukdomar samt mellan gener och sjukdomar från den vetenskapliga litteraturen. Dessa kärndata integreras sedan internt för att generera nätverk mellan kemikalier, gener och sjukdomar. Dessutom integreras kärndata med externa datamängder (t.ex. Gene Ontology- och pathway-annotationer) för att förutsäga många nya samband mellan olika datatyper. En unik och kraftfull egenskap hos CTD är de infererade relationer som genereras genom dataintegration och som hjälper till att omvandla kunskap till upptäckter genom att identifiera nya kopplingar mellan kemikalier, gener, sjukdomar, vägar och GO-annotationer som annars kanske inte skulle vara uppenbara med hjälp av andra biologiska resurser. Orphanet
Orphanet är referensresursen för information om sällsynta sjukdomar och särläkemedel för alla grupper. Syftet är att bidra till att förbättra diagnos, vård och behandling av patienter med sällsynta sjukdomar. Orphanet upprätthåller Orphanet-nomenklaturen, som är nödvändig för interoperabilitet, och Orphanet Rare Disease Ontology (ORDO). Moroccan Genetic Disease Database
Moroccan Genetic Disease Database (MGDD) samlar in och dokumenterar mutationer och frekvenser av polymorfismer som rapporterats i den marockanska befolkningen. Informationen i MGDD gör det möjligt för forskare och kliniker att hitta mutationer som är förknippade med en viss sjukdom eller gen av intresse, och de kan också hitta polymorfismer som är förknippade med känslighet för en genetisk sjukdom eller individuella reaktioner på farmaceutiska läkemedel eller miljöfaktorer. MouseMine @ MGI
En databas med integrerade musdata från MGI, som drivs av InterMine. MouseMine är medlem av InterMOD, ett konsortium av databaser för modellorganismer som har som mål att göra dataanalyser över artgränserna enklare genom fortlöpande samordning och gemensam systemutveckling. Online Mendelian Inheritance in Man
Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) är ett omfattande, auktoritativt kompendium av mänskliga gener och genetiska fenotyper som är fritt tillgängligt och uppdateras dagligen. De refererade översikterna med fulltext i OMIM innehåller information om alla kända mendelska sjukdomar och över 15 000 gener. OMIM fokuserar på förhållandet mellan fenotyp och genotyp. Target Central Resource Database
TCRD är den centrala resursen bakom kunskapshanteringscentret Illuminating the Druggable Genome Knowledge Management Center (IDG-KMC). TCRD innehåller information om mänskliga måltavlor, med särskild tonvikt på fyra familjer av måltavlor som är centrala för NIH IDG-initiativet: GPCR, kinaser, jonkanaler och kärnreceptorer. Olfactory GPCRs (oGPCRs) behandlas som en separat familj. Ett viktigt mål för KMC är att klassificera målens utvecklings- och läkemedelsnivå. Den officiella offentliga portalen för TCRD är Pharos (pharos.nih.gov). Pharos-gränssnittet, som bygger på moderna webbdesignprinciper, ger enkel tillgång till alla datatyper som samlas in av KMC. Med tanke på komplexiteten hos de data som omger varje mål har effektiv och intuitiv visualisering varit en hög prioritet, för att göra det möjligt för användarna att snabbt navigera & sammanfatta sökresultaten och snabbt identifiera mönster. En viktig funktion i gränssnittet är förmågan att utföra flexibla sökningar och efterföljande sökresultat. Gränssnittet bygger på ett RESTful API som ger programmatisk tillgång till alla KMC-data, vilket gör det möjligt att enkelt använda dem i användarapplikationer. Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues 2.0
GIANT2 (Genome-wide Integrated Analysis of gene Networks in Tissues) är en interaktiv webbserver som gör det möjligt för biomedicinska forskare att analysera sina proteiner och intressanta vägar och generera hypoteser i samband med funktionella kartor av mänskliga vävnader i genomskala. Med GIANT2 kan forskarna utforska förutspådda vävnadsspecifika funktionella roller för gener och avslöja förändringar i dessa roller i olika vävnader, allt genom interaktiva visualiseringar och analyser av flera nätverk. Mitochondrial Disease Sequence Data Resource
Mitochondrial Disease Sequence Data Resource (MSeqDR) är en centraliserad bioinformatikresurs för genom och fenom som byggts upp av mitokondriella sjukdomar för att underlätta klinisk diagnostik och forskningsundersökningar av enskilda patienters fenotyper, genomer, gener och varianter. Den integrerar gemenskapens kunskap från expertkurerade databaser med genom- och fenotypdata som delas av kliniker och forskare. Editome Disease Knowledgebase
Editome Disease Knowledgebase (EDK) är en integrerad kunskapsdatabas med RNA editome-sjukdomsassociationer som manuellt kurerats från publicerad litteratur. Den lagrar information om RNA-redigeringshändelser i mRNA, miRNA, lncRNA, virus och RNA-redigeringsenzymer som är associerade med olika mänskliga sjukdomar.